圣佑庙坐落在新疆昭苏县城西北，天山脚下的洪那海河畔，清幽肃穆，壮观宏伟，现存建筑8座，四周围墙环绕，是中国边锤难得的一处古建筑。

圣佑庙建筑宏伟壮观，气氛庄严肃穆，是这一带蒙古族牧民求神祈祷的场所。坐北朝南，布局严整。中轴在线依次陈列有照壁、山门、前殿、大殿和后殿，东西两侧各有硬山顶的配殿，并有东楼、西楼与之相对应。院中还修建有八角形平面的两层两檐楼亭。 大殿的平面为方形，有七开间。二层为歇山顶，出檐深远，举折高。

寺庙座北朝南，前殿，大雄宝殿，后殿，东西配殿等布局对称。主体建筑——大雄宝殿飞檐斗拱，画栋雕梁，鎏金沥粉，气势恢宏。正壁和殿廊上绘有珍禽异兽，奇花异卉，神话传说，历史故事，中国中原传统风格的壁画，廊画等。大殿前，高悬汉文书写的“敕建圣佑庙”匾额。殿内陈设着数百尊佛像，张挂着来自西藏的帐幔，旗幅，锈工极其精美。